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NVIDIA 公布云上端到端基因闡發(fā)解 阿里云聯(lián)袂
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NVIDIA基于其GPU硬件和軟件加快庫與阿里云展開協(xié)作,旨在以開放共建的立場與同伴配合為各行業(yè)企業(yè)供給全棧式的AI加快計較手藝底座。經(jīng)由過程本次協(xié)作,阿里云基因闡發(fā)平臺同樣成為首個正式集成和布置NVIDIAParabricks的海內(nèi)私有云廠商。2022年11月,海內(nèi)某基因測序客戶,經(jīng)由過程阿里云有限制的計較存儲才能和NVIDAParabricks,在短短的一天內(nèi)就完成了6000個全基因組的群體變異檢測事情,僅耗時3天就完成了在新地區(qū)基因檢測營業(yè)的使用布置,其明顯提拔的基因數(shù)據(jù)闡發(fā)體驗得到了客戶的承認。基因組學手藝是是將來精準醫(yī)學的中心之一,基因測序手藝的不竭開展和臨床使用的連續(xù)拓寬,讓基因檢測成為當下醫(yī)療新基建風口下最為惹人存眷的行業(yè)之一,正在興旺向上開展。與此同時,基因數(shù)據(jù)闡發(fā)80%仍舊在利用傳統(tǒng)的HPC集群,61%需求完整自建處理計劃,行業(yè)團體信息化程度較低。跟著下一代測序(NGS)的速率愈來愈快、本錢愈來愈低,數(shù)據(jù)大水正在呈現(xiàn),人們對可會見、高通量、行業(yè)尺度闡發(fā)的需求日趨增加,超大范圍人群行列研討、疾速布置臨檢嘗試室等曾經(jīng)成為中心的營業(yè)場景。阿里云基因闡發(fā)平臺是海內(nèi)首個大眾云的行業(yè)aPaaS平臺,產(chǎn)物遵照GA4GH行業(yè)尺度,供給全托管的serverless基因計較引擎和數(shù)據(jù)使用開放效勞,以容器化的方法大范圍處置生物醫(yī)學數(shù)據(jù),集成Parabricks等行業(yè)軟件和開源東西,構成完好的端到端處理計劃。Parabricks是由NVIDIA開辟、基于GPU的基因測序闡發(fā)加快軟件,供給多種生物信息學東西和功用,比方序列比對、預處置和質(zhì)量目標、變體和漸變檢測、UMI和用于種系、體細胞和RNA闡發(fā)的端到端事情流程??蔀闇y序中間、臨床團隊、基因組學研討職員和新一代測序儀器開辟者供給疾速精確的闡發(fā),大幅度提拔基因組學闡發(fā)的速率和精確性。比照傳統(tǒng)計較形式,在GPU利用ClaraParabricks停止基因闡發(fā)可以包管分歧性的成果,和更高效的計較。阿里云基因闡發(fā)平臺和NVIDIAParabricks的交融立異,經(jīng)由過程構建云上超大范圍的GPU彈性擴大、大范圍的并行調(diào)理和異構計較、片面的基因闡發(fā)東西、靜態(tài)加載基因加快算法、和籠蓋全基因組、腫瘤、RNA等的最好理論優(yōu)化設置,完成基因計較的明顯降本增效,為企業(yè)用戶帶來業(yè)界搶先的基因數(shù)據(jù)闡發(fā)體驗。NVIDIA正主動鞭策AI在包羅醫(yī)療安康、生物迷信等各行各業(yè)的使用。
NVIDIA供給合用于醫(yī)療安康行業(yè)的智能計較平臺NVIDIAClara?,該平臺可用于醫(yī)學影象、基因組學、患者監(jiān)控和藥物研發(fā),并可布置在嵌入式體系、邊沿等任何處所,助力醫(yī)療安康行業(yè)停止立異并放慢完成精準醫(yī)療的目的。作為Clara平臺的一個明星使用,NVIDIAParabricks曾創(chuàng)下過在23分鐘內(nèi)完成整小我私家類基因組DNA序列闡發(fā)的速率記載。包羅天下上最大的遺傳學研討鑒定命據(jù)庫英國生物樣本庫(UKBiobank)、麻省理工學院和哈佛大學旗下的博德研討所(TheInstitute)等環(huán)球醫(yī)學研討機構、制藥公司和生物手藝草創(chuàng)企業(yè)都在接納NVIDIAParabricks來鞭策其新一代的測序事情。2022年GTC,NVIDIA4.0版本公布,對基因組研討職員和生物信息學家布置和擴大基因組測序闡發(fā)管道的方法帶來嚴重的改良。已往幾年來,阿里云與NVIDIA不斷在手藝、市場等多個范疇連結(jié)深化的協(xié)作,為高機能計較和深度進修范疇的企業(yè)供給片面的GPU計較撐持和效勞。本次阿里云基因闡發(fā)平臺和NVIDIA的交融立異,見證單方協(xié)作的進一步拓展和深化。NVIDIA等待與阿里云一同,助力基因行業(yè)上云的“新基建”。Parabricks東西和流程現(xiàn)已上線供裝置。怎樣經(jīng)由過程平臺下載裝置Parabricks
NVIDIA基于其GPU硬件和軟件加速庫與阿里云開展合作,旨在以開放共建的態(tài)度與伙伴共同為各行業(yè)企業(yè)提供全棧式的AI加速計算技術底座。通過本次合作,阿里云基因分析平臺也成為首個正式集成和部署NVIDIA,我公司是一家專業(yè)從事醫(yī)療軟件系統(tǒng) 十余年高科技公司,公司的醫(yī)療軟件系統(tǒng) ,目前用戶遍及全國各地,它價格低廉,部署簡單,極易上手,是醫(yī)院管理者管理決策的好幫手。如有需要請聯(lián)系我們:
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